jasonjason12570 / mimic-iii-project-lung

MIMIC-III-Project-Lung

https://hackmd.io/@Ja0Ap5E1TgCiBi5YqfO_aA/rkH16gRM_

title: 智慧醫療COPD tags: 智慧醫療,COPD description: Professor Fu.

智慧醫療-肺纖維化COPD

主旨：

• 為什麼要做肺纖維化的題目
  • 人體都會由纖維化做修復
  • 其它國家很高，但是台灣很低
  • 優勢：
    • 具有全台灣最多的病人
    • 肺部的權威，肺部最大的議題
    • IRB已通過 目前已請醫療部完成重組的部分
  • 目標：
    • 利用第一次診斷判斷目前的病人將會產生急性惡化與慢性惡化與存活狀態
    • 將影像不OK的部分去除，使得影像部分能夠比較單純
    • 運算目前平均纖維化的比例
    • 將Ｘ光片＋ＣＴ(橫切與縱切)一起輔助判讀
    • 重點：
      • 找出UIP pattern(由外肋膜往內長的)
      • % of the HRCT
      • progressive phenotype(誰是變差的那位人)
    • 臨床試驗：
      • UIP:
        • 具有UIP pattern需要立即用藥
        • 以使其大幅度降低死亡率與惡化氯
      • none UIP:
    • 方法：
      • 利用density mask 去判斷遭高的地方有多少
      • 利用extractiom將肺部取出
      • 利用重組影像將其重新標定
      • CALIPER以商用，可以判斷多少％的惡化
    • hj/6
• 在臨床醫學上，肺部纖維化有許多原因
  • 20% 比如說紅斑性狼瘡等等免疫性疾病
  • 20％ 不明原因
  • 190個病人
  • 超過１０％肺部纖維化
  • 淺在病人
    • 急性惡化
    • 慢性惡化
  • 要找fictures
    • nodules
    • honycombing
    • centrilobular nodules
  • 外在表徵：
    • UIP pattern 由外往內長
    • OP
    • LIP
    • NSIP
    • 手指問題產生
    • 肺功能狀態
    • 電腦斷層
      • 可以一層一層坐下來
  • 可能原因：
    • 什麼樣的病症會讓人更容易死亡
    • 利用影像學預測誰會死亡

題目1:

0401-開會紀錄

• 住院的case有進icu紀錄當作起始點
• icu天數大於總住院天數
• 入院診斷描述-文字內沒有「ＣＯＰＤ或其他跟COPD有關的描述」
  • elix hauser方式去利用共病症切分data使得他可以針對糖尿病是否有copd
  • 適用embalance落差嚴重
• table位置：admission內之diagnosis
• 分群：出院診斷有COPD/ none COPD
• 預測在此次ICU內死亡之COPD可能性

INSTALLATION

XAMPP:

1. cd in C:\xampp\mysql\bin
2. mysql -u root -p -pmysql mimiciiiv14 (使用xampp\mysql\bin內的mysql操作)
3. 1-define.sql
4. 2-index.sql
5. 3-constraints.sql