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bioinformatics_python_cookbook

deg_edger

Repositório contendo alguns códigos em linguagem R.

deseq_imt

Análises de expressão diferencial de genes, baseada em RNA-seq, utilizando DESeq2, fgsea e outras ferramentas R Bioconductor.

dominelinguagemc

Repositório com exercícios executados a partir do curso Aprenda e Domine a Linguagem C do professor Antonio Henrique Reis. Disponível no site Udemy.

exome

fgsea

Análises de enriquecimento funcional de genes utilizando Gene Set Enrichment Analysis (GSEA). Este algorítmo utiliza conjuntos de genes anotados a priori, os quais foram agrupados por estarem envolvidos na mesma via biológica, para obtenção de enriquecimento funcional dos genes obtidos por análises de RNA-seq.

hands-on_with_r

Repositório com fins didáticos e de aprendizagem, baseado no livro: Hands-On Programming With R - Garret Grolemund. Ed. O’Reilly Media Inc.

kallisto_sleuth

Análise de RNA-seq - Abundância de Transcritos Utilizando kallisto, tximport e DESeq2

learn_c

Repositório destinado a armazenar arquivos gerados durante estudo da linguagem C.

ngs-biome-2017

pycrashcourse

rfordata

R for Data Science

rna-seq

tximport

Análises de expressão diferencial de dados de sequenciamento de segunda geração (high-throughput sequencing reads, RNA-seq) realizadas utilizando as ferramentas kallisto.

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