4surix / atomion

Manipuler des concepts physiques/chimiques (atomes, ions, équations, ...) facilement.

atomion's Issues

Egalité entre un proton et un ion hydrogène

Explication

Actuellement, si nous comparons un proton et un ion hydrogène (Proton() == Ion('{H+}')) cela renvoie False.
Cela est dû à la méthode spéciale de l'égalité __eq__ qui compare la représentation des objets, donc comme un proton et un ion ne se note pas pareil la comparaison renvoie faux.

    def __eq__(self, obj: Any) -> bool:
        return repr(self) == repr(obj)

Interrogation

Je ne sais pas si il faut laisser ou corriger cela.
Techniquement un ion hydrogène est un proton, vu que si on enlève l'électron de l'hydrogène il ne reste que le proton; cependant est ce que c'est vraiment identique ?

Solution

Soit l'égalité compare dorénavant le nombre de proton d'un objet.

    def __eq__(self, obj: Any) -> bool:
        return self.proton == obj.proton

Soit on compare seulement le nombre de proton dés qu'un proton et un ion sont comparés entre eux.

    def __eq__(self, obj: Any) -> bool:
        if isinstance(obj, Proton) and isinstance(obj, Ion):
            return self.proton == obj.proton
        else:
            return return repr(self) == repr(obj)

Ajouter un nouvelle objet "Solution"

Explication

Actuellement dans atomion, le regroupement d’espèces le plus complexe que nous pouvons faire sont les molécules.
Cependant il existe d'autre regroupement davantage complexe comme les solutions.
Je pense qu'il serait donc intéressant de rajouter un objet Solution dans le but de simuler différent type de solution avec les différentes espèces qu'elle peut contenir.

Proposition de fonctionnement

L'objet contiendrait dans un dictionnaire les différentes espèces présentes sous la forme : {espèce: quantités}.
L'espèce sera un objet et la quantité sera un entier qui correspondra combien de fois cette espèce est présente.
Plusieurs propriétés peut être définie, par exemple pH pour savoir le pH de la solution.
Un objet SolutionAqueuse permettra de créer une solution avec comme soluté de l'eau distillé directement.

Exemple

from atomion import *

solution = Solution({
    Molecule("H-C(=O)OH"): 10*mol, # 180ml d'acide formique
    Molecule("SiO2"): 1*mol
})

aq = SolutionAqueuse(ml=1000)
solution = aq({
    Molecule("NaCl"): 2*mol # 114g de sel
})

aq = SolutionAqueuse(ml=1000)
solution = aq({
    Molecule("NH3"): 1*mol
})
solution.pH == 9.25