taxonhub_2022's Introduction

taxonhub_2022

A information collector about species using Brazilian Flora for taxonomic search and speciesLink for occurrences search.

Running backend

Windows:

cd src\Backend
npm install
npm start

Linux:

cd src/Backend
npm install
npm start

Running tests

Windows:

cd src\Backend
npm test

Linux:

cd src/Backend
npm test

Running frontend

cd src/Frontend
yarn
yarn dev

Yet to be translated

Requisitos Funcionais

O sistema deve permitir carregar um arquivo do tipo csv de entrada com a lista de espécies a serem buscadas nos sites Flora do Brasil e The Plant List para validação das espécies. 1.1. O sistema deve realizar validações no arquivo de entrada recebido (se o arquivo está vazio, se há linhas em branco, etc). 1.2. O sistema deve ser capaz de extrair as informações contidas no arquivo de entrada e realizar uma busca de informações das espécies fornecidas no site Flora do Brasil, e The Plant List. 1.3. O sistema deve ser capaz de armazenar as informações a cada busca por espécie, caso haja necessidade de retornar a página para não precisar refazer toda a busca. 1.4. O Sistema deve gerar um arquivo de saída do tipo csv com os resultados obtidos nas pesquisas com cruzamento das respostas obtidas dos dois sites para as espécies pesquisadas.
O sistema deve permitir carregar um arquivo de entrada do tipo csv com a lista de espécies, para ser utilizada para obtenção dos dados de ocorrência das espécies disponíveis no GBIF e SpeciesLink. 2.1. O sistema deve realizar validações no arquivo de entrada recebido (se o arquivo está vazio, se há linhas em branco, etc). 2.2. O sistema deve ser capaz de extrair informações recebidas no arquivo de entrada e realizar uma busca de ocorrências diretamente nos sites GBIF e SpeciesLink. 2.3. O sistema deve ser capaz de armazenar as informações a cada busca por espécie, caso haja necessidade de retornar a página para não precisar refazer toda a busca. 2.4. O Sistema deve gerar um arquivo de saída do tipo csv com os resultados obtidos nas pesquisas com cruzamento das respostas obtidas dos dois sites para as espécies pesquisadas.

Stack

React - Tailwind e Chakra com Next.js (front-end)
Node JS (Back-end)
API: Plant List, Flora do Brasil, GBIF e SpeciesLink.

taxonhub_2022's People

Contributors

Stargazers

taxonhub_2022's Issues

Eu como usuário gostaria de saber qual nome estava invalido, porque quero saber qual nome está errado.

Verificar nomes inválidos
Imprimir resultado na tela

Salvar arquivo csv de ocorrências em disco no local desejado

Obter informação do local desejado
Salvar csv no disco local

Validação do arquivo csv para busca de ocorrências

Eu como usuário gostaria de saber se deu certo a busca de ocorrências, porque quero visualizar o inventário em um arquivo csv.

Verificar status da busca
Imprimir resultado na tela
#23

Conectar com API SpeciesLink

Busca de ocorrências no site SpeciesLink

Tela principal

Eu como usuário gostaria de saber se deu erro no upload do arquivo csv, porque quero saber se preciso tentar novamente.

Salvar resultado em um arquivo csv local

Tela de resultados da busca de ocorrências

Cenário de teste

Eu como usuário gostaria de selecionar a busca taxonômica, porque quero saber se o nome da espécie está válido.

Tela de cruzamento FDB e TPL

Salvar csv de busca de ocorrências

#28
Adquirir local para salvar
#27

Integração Front-Back

Imprimir resultado na tela

Botão de salvar o arquivo gerado (CSV)

Cenário de teste

clicar no botão ‘buscar lista’
selecionar um arquivo csv válido com várias espécie
selecionar se é busca de taxonômica ou de ocorrência
clicar no botão de busca
o botão só deve funcionar se todos os campos tiverem preenchidos (enviar arquivo e tipo de busca)
uma tela com botão de cancelar ficará disponível na tela durante a busca no site, , como por exemplo a tela que foi criada no figma: https://www.figma.com/file/JTarTxS0lgFtXoaue6PbUH/TaxonHub---telas?node-id=0%3A1
depois que acabar o carregamento da busca irá aparecer os resultados na tabela desejada
- selecionar ‘salvar arquivo gerado em csv’
- selecionar a pasta na qual será salvado o arquivo gerado
- selecionar o ‘ok’

Imprimir mensagem de erro/sucesso na tela

Verificar se arquivo enviado é do formato csv.

Resolução de certificado vencido da API Flora do Brasil

O certificado da API do Flora do Brasil venceu, por conta disso os dados estão inacessíveis pelo axios no momento.
Será implementado algum método de acessar sem certificado.

Retornar resultados da busca no Flora do Brasil

Logo do site

Tela de busca taxonômica

Pesquisar a partir de arquivo csv no SpeciesLink

Tela de triagem GBIF e SPL

Mostrar resultado da busca taxonômica

Criar um botão select para selecionar busca taxonômica ou ocorrência

Cenário de teste

clicar no botão ‘buscar lista’
selecionar um arquivo csv válido com apenas 1 ou mais espécies espécie
selecionar se é busca de taxonômica ou de ocorrência
clicar no botão de busca
uma tela com botão de cancelar ficará disponível na tela durante a busca no site
depois que acabar o carregamento da busca irá aparecer os resultados na tabela desejada
selecionar ‘salvar arquivo gerado em csv’
selecionar a pasta na qual será salvado o arquivo gerado
selecionar o ‘ok’

Upload de arquivo csv de ocorrência

Eu como usuário gostaria de saber se deu certo a busca dos nomes das espécies, porque quero validar a busca em um arquivo csv.

Conectar com API Flora do Brasil

Pesquisar a partir de arquivo csv no Flora do Brasil

Botão de upload do arquivo csv

Cenário de teste

clicar no botão ‘buscar lista’
selecionar um arquivo csv válido com várias espécie
selecionar se é busca de taxonômica ou de ocorrência
clicar no botão de busca
o botão só deve funcionar se todos os campos tiverem preenchidos (enviar arquivo e tipo de busca)
uma tela com botão de cancelar ficará disponível na tela durante a busca no site, , como por exemplo a tela que foi criada no figma: https://www.figma.com/file/JTarTxS0lgFtXoaue6PbUH/TaxonHub---telas?node-id=0%3A1
depois que acabar o carregamento da busca irá aparecer os resultados na tabela desejada
selecionar ‘salvar arquivo gerado em csv’
selecionar a pasta na qual será salvado o arquivo gerado
selecionar o ‘ok’

Validação do arquivo csv para busca taxonômica

Salvar csv de busca taxonômica

#26
Adquirir local para salvar
#27

Eu como usuário gostaria de saber qual linha que deu erro de validação no arquivo csv, porque quero saber o quanto que o arquivo foi validado.

Verificar qual linha deu erro na validação
Imprimir resultado na tela

Reorganização das telas

Mostrar resultado das ocorrências

Eu como usuário gostaria de selecionar a busca de ocorrências, porque quero coletar os dados de inventário do site SpeciesLink

Organizando as pastas do Frontend e instalações

Eu como usuário gostaria de fazer o upload do arquivo csv, porque quero validar se os nomes estão corretos e seus níveis de confiança.

Botão de pesquisar

Cenário de teste

clicar no botão ‘buscar lista’
selecionar um arquivo csv válido com várias espécie
selecionar se é busca de taxonômica ou de ocorrência
clicar no botão de busca
o botão só deve funcionar se todos os campos tiverem preenchidos (enviar arquivo e tipo de busca)
uma tela com botão de cancelar ficará disponível na tela durante a busca no site, , como por exemplo a tela que foi criada no figma: https://www.figma.com/file/JTarTxS0lgFtXoaue6PbUH/TaxonHub---telas?node-id=0%3A1
depois que acabar o carregamento da busca irá aparecer os resultados na tabela desejada
selecionar ‘salvar arquivo gerado em csv’
selecionar a pasta na qual será salvado o arquivo gerado
selecionar o ‘ok’