leeclab / ms_mammals_sp_spatial_analysis Goto Github PK

Linha 149 do 00_prepara_data.R:
dplyr::left_join(., rbind(unique(ca_occ[, c(2, 3, 4)]), tax), by = "genus") %>%

Seria:
dplyr::left_join(., rbind(unique(ca_occ[, c(2, 3, 4)]), ba_tax), by = "genus") %>%

Oi @mauriciovancine ,

O script 01 roda perfeito e o 02 está rodando e gerando as figs. Deve levar um tempinho para terminar, mas só dando uma diagonal, não tenho nada a modificar.

abs

A linha 044 de 00_prepara_data.R:

ba_tax <- readr::read_delim("data/ATLANTIC_BATS_Capture.csv", delim = ",", quote = "") # correcoes nas linhas

tenta solucionar um problema com a formatação, mas chama o arquivo inexistente na pasta data
Ajustei com:
ba_tax <- readr::read_delim("data/data_papers/ATLANTIC_BATS_Capture.csv", delim = ",", quote = "") # correcoes nas linhas
mas o output está bem estranho:

Não tenho interesse nos dados de morcegos, mas chamo o issue aqui pq parece interferir no bind com o CamTraps na sequência...

Rodar o código direto na linha 046, ignorando a linha anterior, gera o erro:

Error in `dplyr::mutate()`:
! Problem while computing `species =
  str_replace(Species, "[.]", " ")`.
Caused by error in `stri_replace_first_regex()`:
! object 'Species' not found