stechy1 / mri_tms_viewer

Semestrální práce pro předmět KIV/DVM

MRI/TMS viewer

Aplikace pro vizualizaci magnetické rezonance

Závislosti

Pro správnou funkčnost je potřeba stáhnout knihovnu ze stránek https://imagej.nih.gov/ij/download/jars/ij149v.jar

mri_tms_viewer's Issues

Nechtěnné zavření okna

Když si zobrazím informace o aplikaci a dialog zavřu, nečekaně se zavře celá aplikace.

Aktualizace kódu

Už jsme dostali poslední verzi kódu.
Bylo by fajn, kdyby se všechny změny, co jsme provedli v branchi reverse_engineering aplikovaly do branche master.

Zrušení zvýraznění bodu

Když kliknu mimo označený bod, bylo by fajn, kdyby již nebyl tak veliký.

Need MRI data

Sharni mi někam ty data ať taky můžu něco dělat, na discordu nejsi na steamu taky ne.. 😢

Counter snímků

Bylo by dobré ponechat nějaké číslo právě zobrazovaného snímku, jako bylo ve staré verzi.
Případně při překlikávání z obrazu MRI na TMS ponechat slider na stejném snímku.

Seznam hodnot

Z dat, která máme je potřeba vysosat veškeré hodnoty, které by mohly mít něco společného s amplitudou, kterou máme implementovat do programu.

Vylepšení UX hlavního okna obrazovky

V aktuální chvíli jsou všechna tlačítka na hlavní obrazovce aktivní.
Bylo by fajn, kdyby byla aktivní pouze ta tlačitka, která odpovídají danému stavu aplikace.
Konkrétně třeba tlačítka načíst MRI/TMS. Není moc vhodné načítat TMS, když jsem ještě nenačetl MRI. To samé s tlačítkem informace o obrázku.

Error při obrázek nelze uložit

Nullpointerexception při snaze "uložit aktuální obrázek" nebo "uložit všechny obrázky" a potom cancel

java.lang.NullPointerException
at view.centerPane.ImagePanel.saveImages(ImagePanel.java:264)
...

Exception in thread "AWT-EventQueue-0" java.lang.NullPointerException
at view.centerPane.ImagePanel.saveImg(ImagePanel.java:290)
...

Změna názvu skupiny

Když změním název jedné ze dvou výchozích skupin (nepoužívané, ignorované), tak se začne vypočítávat konvexní obálka kolem bodů + velikost plochy.
Asi by bylo dobré tomuto chování předejít tak, že tyto skupiny nepůjdou přejmenovat, nebo budou mít nějakou skrytou vlastnost, která tomu zabrání.

Zvýraznění bodu

Pro lepší pocit z UX by bylo dobré, aby byl bod se kterým se pracuje zvýrazněn.

Design

Implementace vzhledu tak, aby to co nejvíce připomínalo původní aplikaci.

Při zvýraznění skupin se objevuje starý kód

Pokud projíždím zvýrazněné skupiny, tak tam občas problikává zvýrazněná skupina, která je úplně mimo? Vypadá to na starý kód

Aktualizace v okně nastavení

Otevřu nastavení a dám změnit název/barvu skupiny.
Po uložení změn se v okně s nastavením neprovedou požadované změny.
Tyto změny jsou ale vidět v nově vytvořeném okně.
Bylo by fajn, aby se tyto změny provedly v aktuálně otevřeném nastavení.

Java error při načtení TMS

Při načtení tms vyskočí INFO okno, zda chceme data načíst ze souboru. Po odkliknutí "Yes" vyskočí tato chyba v konzoli. Program běží bez problémů dál.

java.io.InvalidClassException: model.MyPoint; incompatible types for field pixelValue
at java.io.ObjectStreamClass.matchFields(ObjectStreamClass.java:2299)
at java.io.ObjectStreamClass.getReflector(ObjectStreamClass.java:2193)
at java.io.ObjectStreamClass.initNonProxy(ObjectStreamClass.java:669)
at java.io.ObjectInputStream.readNonProxyDesc(ObjectInputStream.java:1843)
at java.io.ObjectInputStream.readClassDesc(ObjectInputStream.java:1713)
at java.io.ObjectInputStream.readOrdinaryObject(ObjectInputStream.java:2000)
at java.io.ObjectInputStream.readObject0(ObjectInputStream.java:1535)
at java.io.ObjectInputStream.defaultReadFields(ObjectInputStream.java:2245)
at java.io.ObjectInputStream.readSerialData(ObjectInputStream.java:2169)
at java.io.ObjectInputStream.readOrdinaryObject(ObjectInputStream.java:2027)
at java.io.ObjectInputStream.readObject0(ObjectInputStream.java:1535)
at java.io.ObjectInputStream.readObject(ObjectInputStream.java:422)
at java.util.ArrayList.readObject(ArrayList.java:791)
at sun.reflect.NativeMethodAccessorImpl.invoke0(Native Method)
at sun.reflect.NativeMethodAccessorImpl.invoke(NativeMethodAccessorImpl.java:62)
at sun.reflect.DelegatingMethodAccessorImpl.invoke(DelegatingMethodAccessorImpl.java:43)
at java.lang.reflect.Method.invoke(Method.java:498)
at java.io.ObjectStreamClass.invokeReadObject(ObjectStreamClass.java:1058)
at java.io.ObjectInputStream.readSerialData(ObjectInputStream.java:2136)
at java.io.ObjectInputStream.readOrdinaryObject(ObjectInputStream.java:2027)
at java.io.ObjectInputStream.readObject0(ObjectInputStream.java:1535)
at java.io.ObjectInputStream.readObject(ObjectInputStream.java:422)
at model.dialogWindow.LoaderTask.importGroupsFromFile(LoaderTask.java:206)
at model.dialogWindow.LoaderTask.loadTmsFiles(LoaderTask.java:316)
at model.dialogWindow.LoaderTask.doInBackground(LoaderTask.java:47)
at model.dialogWindow.LoaderTask.doInBackground(LoaderTask.java:27)
at javax.swing.SwingWorker$1.call(SwingWorker.java:295)
at java.util.concurrent.FutureTask.run(FutureTask.java:266)
at javax.swing.SwingWorker.run(SwingWorker.java:334)
at java.util.concurrent.ThreadPoolExecutor.runWorker(ThreadPoolExecutor.java:1149)
at java.util.concurrent.ThreadPoolExecutor$Worker.run(ThreadPoolExecutor.java:624)
at java.lang.Thread.run(Thread.java:748)

Ovládací panel vyhazuje NullPointery

Při snaze ovládat panel, pokud nejsou načtena žádná data (ani MRI ani TMS) vyhazuje program hromadu NullPointerException. Stejně tak fungují i tlačítka s informacemi o snímku, ukládání, vygenerovaní skupiny atd.