wcota / covid19br Goto Github PK

**fechei por que pensei ter resolvido

Pode dar uma olhada nisso em algum momento, por favor?

There are 1670 negative entries for newCases and 165 negative entries for newDeaths in cases-brazil-cities-time.csv file. I noticed that because I'm using the EpiForecasts packages and noticed negative cases in "Santa Catarina" cases plots in their posts: https://epiforecasts.io/covid/posts/national/brazil/

They are using your data to generate the Brazilian analysis.

How to reproduce:

library(dplyr)
read.csv("https://raw.githubusercontent.com/wcota/covid19br/master/cases-brazil-cities-time.csv") %>%
    filter(newCases < 0)

Output (first 5 lines):

 date country state                             city  ibgeID newDeaths deaths newCases totalCases
1  2020-03-12  Brazil    RJ CASO SEM LOCALIZAÇÃO DEFINIDA/RJ      33         0      0       -9          1
2  2020-03-18  Brazil    PE       Jaboatão dos Guararapes/PE 2607901         0      0       -1          1
3  2020-03-19  Brazil    SP                   Santo André/SP 3547809         0      0       -4          2
4  2020-03-19  Brazil    SP            São Caetano do Sul/SP 3548807         0      0       -5          1
5  2020-03-20  Brazil    MG                    Uberlândia/MG 3170206         0      0       -1          1
...

O número de casos novos do dia 28-03 é negativo em:
https://github.com/wcota/covid19br/blob/master/cases-brazil-states.csv

É normal isto?

@wcota , thx pelo trabalho.

Favor verificar estado RJ commit 078f0f1, anexo numeros
Os recuperados, existe a possibilidade de ter estes dados por municipio ?

obrigado
julio
rj2020-04-30.zip

Trabalho muito bom, está sendo de extrema ajuda para o corpo de bombeiros

2020-05-01 | Brazil | SC | TOTAL | 2 | 50 | -290

Meus caros, seria interessante adicionar o código do município aos dados, em uma coluna talvez, assim fica mais fácil fazer a união e cruzamento com outros dados do IBGE como os shapefiles, dados de população, etc. https://www.ibge.gov.br/explica/codigos-dos-municipios.php
O Brasil.io também está fazendo esse mesmo levantamento, talvez fosse interessante vocês conversarem e unirem forças.
Abraços

Oi Wesley! Primeiramente parabéns pelo trabalho. Estou com uma dúvida sobre os dados do RN. Me parece que estão shiftados. Note que o valor mais recente está como 0 e que as demais estão com um lag 1. No geral difere da fonte. Abs obrigado

No csv cases-brazil-cities-time.csv do commit 67f1116, a coluna newCases está apresentando valores negativos para diversas linhas. Isso é esperado? Obrigado desde já.

Temos um site com relatórios criados a partir de jupyters https://covid19graficos.github.io/ gostaria da permissão para utilizar os seus dados. Atualmente utilizamos o Brasil.io mas há dados ausentes em algumas datas.

Greetings. Thank you again for your work. Unfortunately, I believe the number of recoveries for 6/19 for Piaui is incorrect. The latest change moves the recoveries from 734 to 13029. Per the state reporting on twitter (https://twitter.com/GovernodoPi/status/1274495236148953088?s=20), I believe the current number should be 821.

O número de mortes diárias no dia 12/05/2020 para todo o Brazil (newDeaths em cases-brazil-states.csv) está como 772. Entretanto, foram noticiados na mídia 881 registros de mortes neste dia.

Estados do RN, SP, TO, MS com 0 novos casos no dia 28/07/2020, está correto?

Chegaram a ver os dados em https://brasil.io/dataset/covid19/caso ?

Dei uma olhada rápida, e parece que tem algumas diferenças durante a série histórica, mas quase nenhuma nas datas de hoje. Será que usaram um critério diferente para atribuir os casos aos dias?

Como estão recebendo dados do PR, pelo brasil.io? Vejo apenas dados do dia 22/04
Mas nesse link do governo do PR já tem dados de hoje 25/04 http://www.saude.pr.gov.br/modules/conteudo/conteudo.php?conteudo=3507

@wcota,

Bom dia !

Algumas capitais, faltam dados em cases-brasil-cities-time.csv

commit 37c34f8,
Curitiba, faltando novos casos e novos obitos, nos 3 dias finais do arquivo.

Recife, tem um probleminha de valor negativo em novos casos em 2020-04-24
17,2020-04-24,Brazil,PE,Recife/PE,2611606,26010,Recife,14,152,-415,1647,9.23604,100.07735,0.09229,SES,2020-07-24
Sei que podem ocorrer, em todo caso, so para constar.

obrigado,

julio
cartognu.org/covid19

É possível incluir a coluna de casos fatais por cidades para os seguintes arquivos?
gps_cities.csv
cases-brazil-cities-time.csv
O segundo precisaria dos dados por data né mas se for possível incluir no primeiro arquivo.
Obrigado.

Meu caro, bom dia!
Eu penso e repenso muitas vezes antes de abrir um issue, pois nem imagino o trabalho que vocês estão tendo! Peço licença para dividir mais uma questão:

1- Na Paraíba, existe 1 caso no dia 08/05 e uma morte no dia 30/05 que constam como "Sem Localização Definida". Eles, no final, somam como um excedente ao número real divulgado pela SES. Foi um erro da secretaria ou há alguma especificidade sobre esses dias? Há algum tempo eu venho apagando eles esperando ser corrigido naturalmente, mas ainda persistem e resolvi compartilhar.

2- Outra questão é que, aparentemente (pensando muito aqui, rs), acredito que os dados individualizados do dia 14/06 estão somados aos do dia 15/06 (a compensação dos casos SLD no dia 14 está registrada no dia 15)

Como eu trabalho com os dados, tanto por município quanto por semana epidemiológica, esses detalhes de individualizações ficam contrastados pra mim; por isso essas questões tão específicas! Obrigado pela sua dedicação!

Um abraço!

Boa noite!

Ontem e hoje observei discrepâncias nos dados de casos do município de Sousa-PB
O valor do dia 16 está negativo e a variação dos ultimos dias está diferente do boletim oficial

O que houve nesses dias que causou essa distorção?
O Arquivo que peguei esses dados é o:
cases-brazil-cities-time.csv.gz
Por exemplo Berford Roxo/RJ:

• 06/11 (0 casos novos e 11206 casos totais)
• 07/11 (11120 casos novos e 22326 casos totais)
• 08/11 (-11179 casos novos e 11147 casos totais)

Existem outros casos, só postei essa dúvida mesmo

Olá, tudo bem ?

Primeiramente, muito obrigado pelo ótimo trabalho com os dados/site!
Desde hoje, a coluna deathsMS a partir daqui https://github.com/wcota/covid19br/blob/master/cases-brazil-states.csv#L1724 está constando zerada. O mesmo na mesma coluna no arquivo https://github.com/wcota/covid19br/blob/master/cases-brazil-total.csv . Sua ideia é deixar de atualizá-las ?

Abração

Seria interessante acrescentar os casos sob investigação, ou seja, que amostras de sangue foram coletadas mas o resultado do teste ainda não saiu (pelo menos óbitos que estão em teste - EX: https://g1.globo.com/pb/paraiba/noticia/2020/03/23/paraiba-tem-mais-duas-mortes-de-pessoas-com-suspeita-de-coronavirus-segundo-secretaria.ghtml). Muita gente se ilude com esses números e está despreocupada pelo fato de que a doença "ainda não tenha chegado em sua respectiva cidade". Além de tornar o mapeamento da doença um pouco mais preciso.

Algumas cidades não estão com informação como por exemplo São Desidério e Correntina.
Não sei se não existem mesmo dados ou foi apenas lapso.

@wcota

Sei das enormes dificuldades em compilar os dados, mas creio que isolamento social e testes sao dados importantes para analises. Poderiam colocar na fila de desejos !

obrigado e
[]s
julio

Sugestão de apresentar, no site, os casos ativos (que imagino que podem ser calculados com base nos dados de casos recuperados, mortes e casos totais).

Alguns sites como o worldometers calculam da seguinte forma:

Active Cases = (total cases) - (total deaths) - (recovered). This figure represents the current number of people detected and confirmed to be infected with the virus. This figure can increase or decrease, and represents an important metric for Public Health and Emergency response authorities when assessing hospitalization needs versus capacity.

Entretanto, não encontrei algum site que apresente essa informação por região ou município, no Brasil.

Greetings. Thank you so much for your work, it helps everyone immensely. Unfortunately, I believe the number of recoveries for 6/15 for Piaui is incorrect in the latest commit (7c8de16). This changed the number of recoveries from 696 to 9820. Per the state reporting (https://twitter.com/GovernodoPi/status/1272688767799787520/photo/1) I believe the number should have gone from 696 to 709.

Eles botaram um CSV pra download (FINALMENTE) dos dados no site oficial do governo: https://covid.saude.gov.br/

só bater nessa url: https://covid.saude.gov.br/assets/files/BRnCov19_30032020.csv

tem que ver se não vai mudar o link amanhã @wcota

porém, ainda é apenas por estado

olá

depois do update de cidades do MS os números de newDeaths deram uma pirada.
26/5 tinham 1056 pulou para 1590
e
27/5 que já tava com mais de mil caiu para 520

Meu nobre, boa noite!
Você teria acesso e/ou como disponibilizar os dados de casos descartados por município? A ideia é poder calcular o número de testes realizados somando os valores de descartados+confirmados.
Abraços!

@wcota

No commit 2826326, os dados de TO,MS,RN estao com zero.
Teria como confirmar ?

obrigado,
julio
cartognu.org/covid19

Using 'cases-gps.csv' I was able to made a map using flutter if anyone is interested this is the repo:
https://github.com/Gabplay/flutter_covid19_brasil

@wcota

Sera que tem algum engano no CE ?
Novos casos: 9427

obrigado,
julio
cartognu.org/covid19

Fala @wcota, aqui quem fala é um fã desse trabalho sensacional que vcs tão fazendo!

Trabalho na @EscolaDeSaudePublica do Ceará e estamos responsáveis pelo site e painel de informações sobre o Covid no estado.

Inclusive, hoje mesmo estamos liberando nossa API, pra acesso aos dados que estamos usando pra montar o painel: https://coronavirus.ceara.gov.br/painel

Te chamei no telegram, mas notei que vc não olha há mais de mês... Queria marcar um papo contigo, pra gente trocar idéia sobre estrutura e plotagem de dados.

Também ia te chamar pro grupo que criamos no telegram, pra juntar cabeças e projetos desse tipo: https://t.me/grupoanticorona (mais informações sobre o grupo e a força tarefa digital que criamos no ceará: bit.ly/ForcaTarefaAntiCorona )

Fizemos uma estimação do R0 em função do tempo, para o nosso simulador: https://covid-simulator.3778.care/

Foi utilizando os dados de vocês! Muito obrigado.

Fiquem a vontade para usar o código (https://github.com/3778/COVID-19/blob/master/covid19/estimation.py), que é uma implementação do EpiEstim do R.

Implementar análise e coleta dos dados por municípios utilizando os novos dados disponibilizados pela plataforma oficial do MS.

Isso será trabalhado no branch https://github.com/wcota/covid19br/tree/minSaudeMunicipios

Eventuais problemas:

• Formato do arquivo CSV (que agora é uma planilha do Excel) do MS muda sempre.

troquei minha rotina para baixar o gz e unzipar ele, mas só para deixar registrado o csv não foi atualizado em 2 dias

Opa, vi que Alagoas está zerado em novos casos e mortes no dia 8 de junho.
Mas o informe epidemiológico do dia não confirma isso.
Só pra avisar, muito obrigado pelo trabalho!

Olá Wesley,

Vc poderia por favor rechecar este valor negativo em SC nos casos novos para a última data:

É esperado?

Good evening @wcota . It looks like the recoveries are somehow doubling from the state data right now (Aug 15 01:51 GMT). For example, Alagoas is reporting 65k recoveries but https://github.com/wcota/covid19br/blob/master/cases-brazil-total.csv lists 130k. Similarly, Minas Gerais is reporting 135,981 but the file has 271,962 (exactly double). This seems to hold for all the recoveries in the file this evening. Thanks again for your work!

Hi there!
First. Congrats on your great work!
Second. Are you tracking of all Brazilian cities? If so, how reliable are your sources?.
Regards,

Parabéns pelo trabalho! Poderia disponibilizar o script de atualização dos dados?

https://g1.globo.com/rs/rio-grande-do-sul/noticia/2020/03/25/prefeitura-de-porto-alegre-confirma-primeira-morte-por-coronavirus-no-rs.ghtml

Tem como adicionar o número de recuperações e suspeitos do arquivo abaixo no CSV dos casos por estado ou em outro CSV? Criei o site https://mapacoronavirusbrasil.com/ com os seus dados e achei interessante exibir também esses dados.

https://docs.google.com/spreadsheets/d/1MWQE3s4ef6dxJosyqvsFaV4fDyElxnBUB6gMGvs3rEc/edit#gid=1503196283

cases-brazil-total.csv commit 57af3ce,

@wcota , estao zerados os testes de RJ e AM.

obrigado pelo seu trabalho.

julio
cartognu.org 2020-05-20

Hello,
Your dataset was added to CoronaWhy (https://www.coronawhy.org/) Data Lake on Dataverse as a piece of common COVID-19 data frame http://datasets.coronawhy.org/dataset.xhtml?persistentId=doi:10.5072/FK2/RRBPP7
Would you be willing to help with the maintenance of your dataset in Dataverse, e.g. adding the relevant metadata and keeping the dataset up-to-date? That will help to make the dataset findable and accessible for the medical science community.

Olá, juntamente com uma organização sem fins lucrativos, estamos tentando centralizar as informações de infectados / mortos / recuperados covid-19 e estamos procurando uma pessoa encarregada de cada país. No seu caso, Brazil.

O formato csv está sendo tratado de acordo com o formato global https://github.com/CSSEGISandData/COVID-19 para poder coletar os dados.
Isso inclui as seguintes colunas:

Para a Brazil, é necessária atualização diária para esses lugares:

Você poderia me dizer se está interessado em contribuir, por favor.
O conjunto de dados centralizado é proposto neste repositório:
https://github.com/DataScienceResearchPeru/covid-19_latinoamerica

Seria interessante adicionar lista de fatalidades também.

temos como criar uma coluna de número de mortes na tabela cases-brazil-states.csv?

Aparenta estar mostrando em horas e não em dias.